在马尼拉号进入吴淞口的时候，就有上海关的快哨船上前去负责引航并进行登记如果马尼拉号是商船，那么就会被带去空着的商用码头停泊，或在商用码头附近排队等候。
等商船完成停靠后，就会有上海关的税务官过来根据船只的大小（根据长度、宽度计算）征税现在大明的海关税采取的是从船征收和入港即征的方法。
税率不高，但是会重复征税。
商船可以缴纳金银铜等贵金属，也可以缴纳稻谷或小麦。因为稻谷和小麦的折价较高（以大明各处口岸的粮价为参考，但是价格肯定比南洋的产粮区贵很多），所以一般的商船都会装载稻米入关，用于缴纳关税。
不过马尼拉号并不是商船，而是一艘执行外交任务的军舰。所以不必缴纳关税（也不许进行大宗的商业交易），也不能随意在商用泊位停靠，而是要在上海外交事务的泊位停靠。
那些穿着军服铁甲充当仪仗队的军人，就是从天津已经南下的帝国海军大学的学员。
而在马尼拉号停靠码头的同时，上海关的官差就将西班牙国使臣来访的消息通报给了上海市长兼外交通商大臣乔大升。
现在的大明帝国仍然没有一个外交部，而是将外交事务分成了外藩事务和外国事务。其中外藩事务由礼部主客司负责管理，而外国事务则由户部外交通商司管理。
而上海外交通商大臣就是户部外交通商司下属的十三个（其中8个商市正在筹备中）通商外交大臣之一其余三个分别是广州通商外交大臣、泉州通商外交大臣、宁波通商外交大臣。
外交通商大臣可以专任，也可以由五大商埠的主官兼任。
乔大升的外交通商大使就是个兼职，他现在的本职是上海商市市长，上海商埠最早属于上海县管理。但是这三四年来商市发展速度很快，几乎是一天一个样，三年大变样了。一个小小的上海县已经管不了这个大大的上海商埠了。
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